В него были включены Дагестанский государственный университет, Дагестанская государственная медицинская академия, Дагестанский государственный педагогический университет, Дагестанский государственный технический университет и Дагестанский государственный аграрный университет имени М.М. Джамбулатова. Была проанализирована и деятельность 29 филиалов. Критериями оценки вузов стали образовательная, научно-исследовательская, международная, финансово-экономическая деятельности, инфраструктура. Показатели филиалов оценивались по приведенному контингенту, доле кандидатов и докторов наук в численности работников и доле работников профессорско-преподавательского состава в общей численности, работающих без совместительства и не по договорам гражданско-правового характера. 

В результате анализа эффективной была признана только работа Дагестанского государственного университета, а также 15-ти филиалов. О том, что республика рискует потерять свои вузы, Магомедсалам Магомедов был уведомлен 26 октября.

Учебные заведения, оказавшиеся в числе неэффективных, рискуют быть расформированными в том случае, если правительство республики не сможет убедить Минобрнауки России в значимости конкретного вуза либо филиала. Если комиссию все-таки удастся убедить в эффективности вуза для региона, он будет исключен из перечня неэффективных учебных заведений и вопрос о его реорганизации либо закрытии комиссией рассматриваться не будет. Представить свою позицию республика должна к 8 ноября, ко дню заседания межведомственной комиссии, на котором и будет решаться судьба дагестанских вузов и филиалов.