Напомним, что Исламудина Агаева подозревают в мошенничестве в особо крупном размере. По версии следствия, в течение двух лет — с 2011 года вплоть до задержания — Исламудин Агаев давал главному бухгалтеру дирекции и бухгалтеру-кассиру указания составлять заявки на получение денежных средств по системе электронного денежного оборота. Деньги были перечислены на счет учреждения Комитетом по делам молодежи Дагестана. Агаев подписывал их своей электронно-цифровой подписью. Документы направлялись по электронной почте в республиканское управление Федерального казначейства. Затем с расчетного счета учреждения снимались деньги, а чтобы скрыть следы преступления, как полагает следствие, Агаев давал указания главному бухгалтеру о составлении поддельных документов — расходных кассовых ордеров на общую сумму более 38 млн руб. В итоге на свои нужды руководитель дирекции потратил 199 млн руб., по версии следователей. 
Задержанному бухгалтеру также предъявлено обвинение в мошенничестве.